Examen des infections opportunistes liées au type de virus de l’immunodéficience humaine en Afrique subsaharienne

Comprendre l’histoire naturelle des infections VIH et opportunistes de type virus de l’immunodéficience humaine en Afrique subsaharienne est nécessaire pour optimiser les stratégies de prophylaxie et de traitement des infections opportunistes et pour comprendre l’impact probable de la thérapie antirétrovirale Nous avons entrepris une revue systématique de la littérature sur Infection par le VIH en Afrique subsaharienne pour évaluer les données des cohortes récentes et des études transversales sélectionnées afin de déterminer les taux d’infections opportunistes, les numérations cellulaires CD associées et la mortalité associée Nous avons consulté la base de données MEDLINE et la base de données Cochrane des revues systématiques et Cochrane Clinical Trials Register pour la littérature anglophone publiée d’avril à octobre La tuberculose, les infections bactériennes et le paludisme ont été identifiés comme les principales causes de morbidité liée au VIH en Afrique subsaharienne. le moment du diagnostic des infections opportunistes était Les grandes politiques concernant le type et le moment de la prophylaxie opportuniste de l’infection peuvent être spécifiques à une région et nécessitent d’urgence une étude plus approfondie

Une fois infectée par le VIH-, la progression vers le SIDA et la mort prématurée est la réalité pour les gens dans la plupart des pays pauvres L’infection s’est propagée à>% de la population dans les pays sub-sahariens et plusieurs autres sont proches. le fardeau de la maladie a abouti à & gt; millions de décès liés au VIH dans et a réduit l’espérance de vie moyenne en Afrique subsaharienne d’une année prévue à ~ ans aujourd’hui Sur la base des tendances actuelles, un Zimbabwéen d’un an, né en, aura un% – % des risques d’infection par le VIH et de mort prématurée L’impact sur les individus, les familles et les économies africaines est profond Bien que les efforts de prévention continuent, une attention croissante est accordée au traitement des personnes déjà infectées par le VIH. Le traitement par triméthoprime-sulfaméthoxazole TMP-SMZ, pilier de la pneumonie à Pneumocystis carinii PCP en Amérique du Nord, en Europe et en Australie, a donné des résultats prometteurs, notamment dans la prévention des infections bactériennes graves . concernant le rôle de la prophylaxie antituberculeuse, de la prophylaxie contre les espèces de Cryptococcus et de l’utilisation des vaccins En outre, l’utilisation du HAART en Côte d’Ivoire, au Sénégal, en Ouganda et dans d’autres pays à faible revenu Le cadre existant de soins et de politiques cliniques aux États-Unis et en Europe a été développé en utilisant des études de cohorte délimitant les taux d’infections opportunistes et le rôle du laboratoire. En Afrique subsaharienne et dans la plupart des pays à faible revenu, les relations entre ces paramètres sont beaucoup moins claires, en partie à cause de la rareté des cohortes avec des tests de laboratoire complets et des diagnostics. Nous examinons ici la littérature existante sur les infections opportunistes associées au VIH en Afrique subsaharienne, en mettant l ‘accent sur des études transversales récentes et des cohortes fournissant des taux d’ incidence, des numérations cellulaires CD au moment où surviennent les infections opportunistes. , et la survie associée à des infections spécifiques Nous discutons des implications de ces données pour la prophylaxie est d’infections opportunistes et l’introduction de HAART, et nous discutons des directions pour les domaines de recherche futurs

Méthodes

Recherche documentaire Nous avons effectué une recherche dans la base de données MEDLINE et la base de données Cochrane des revues systématiques et des essais cliniques Cochrane pour la littérature anglophone publiée en avril. « Afrique », « VIH », « SIDA », « bactériémie », « Candida ». « , « candidose », « Cryptococcus neoformans », « cryptococcose, » « Cryptosporidium », « cytomégalovirus », « diarrhée », « entérites, » « herpès zoster », « Isospora belli », « Isosporidiose » « paludisme », « la méningite « , « microsporidies », « Mycobacterium avium complexe », « Mycobacterium tuberculosis », « pneumocystose » PCP « pneumonie », « Salmonella », « Streptococcus pneumoniae », « Toxoplasma gondii », « toxoplasmose, » et « varicella virus du zona « Nous avons également effectué une recherche manuelle des références des publications et des experts consultés dans le domaine. Deux examinateurs CBH et EL ont examiné les listes de titres et d’abrégés et ont utilisé Critères d’inclusion Pour évaluer l’incidence des infections opportunistes chez les adultes infectés par le VIH, nous avons inclus des études observationnelles de cohortes de patients infectés par le VIH et des groupes placebo d’essais contrôlés randomisés de thérapie préventive ou de Essais vaccinaux réalisés en Afrique subsaharienne Les études sélectionnées ont été évaluées pour les numérations cellulaires CD signalées au moment de l’infection ou à proximité et pour la mortalité. Les études transversales ont été évaluées pour les études suivantes: sélection consécutive ou systématique des patients infectés par le VIH admis à l’hôpital ou à la clinique, produisant la prévalence d’une infection opportuniste; patients consécutifs infectés par le VIH se présentant dans des établissements de santé avec un complexe de symptômes, par exemple, toux et fièvre, produisant la prévalence d’une infection opportuniste chez les patients présentant ce complexe symptomatique, par exemple une pneumonie pneumococcique; ou autopsie des décès consécutifs d ‘individus infectés par le VIH, donnant la prévalence d’ une infection opportuniste

Résultats

Pour chacune des infections opportunistes décrites dans cette section, les taux de prévalence sont présentés en premier, suivis des taux d’incidence, des données sur les cellules CD et des données sur la mortalité. Les pays dans lesquels des études d’infections spécifiques ont été réalisées sont également présentés.

Figure View largeTélécharger la diapositive Emplacement d’études sélectionnées sur les infections opportunistes en Afrique subsaharienne C, Cryptococcus neoformans; CA, Candida albicans; CM, cytomégalovirus; CS, espèces de Cryptosporidium; Moi, Isospora Belli; M, paludisme; MA, complexe de Mycobacterium avium; MS, espèces de Microsporidium; P, pneumonie à Pneumocystis carinii; S, espèces de Salmonella; SP, Streptococcus pneumoniae; T, toxoplasmose; TB, Mycobacterium tuberculosis; V, virus de la varicelle et du zonaFigure View largeTélécharger la diapositive Emplacement d’études sélectionnées sur les infections opportunistes en Afrique subsaharienne C, Cryptococcus neoformans; CA, Candida albicans; CM, cytomégalovirus; CS, espèces de Cryptosporidium; Moi, Isospora Belli; M, paludisme; MA, complexe de Mycobacterium avium; MS, espèces de Microsporidium; P, pneumonie à Pneumocystis carinii; S, espèces de Salmonella; SP, Streptococcus pneumoniae; T, toxoplasmose; TB, Mycobacterium tuberculosis; V, virus de la varicelle et du zona

Infections mycobactériennes

M tuberculose La tuberculose a été diagnostiquée chez% -% de patients VIH-positifs consécutifs hospitalisés au Kenya et en Afrique du Sud ,% de Tanzaniens ruraux présentant des symptômes respiratoires , et% de patients burundais atteints de SIDA Tuberculose a été diagnostiqué par frottis ou culture d’un échantillon d’expectoration et / ou lavage broncho-alvéolaire ou biopsie transbronchique en% de patients rwandais à frottis négatif ,% de patients hospitalisés au Burundi ,% de patients en salle respiratoire à Abidjan , % de patients hautement sélectionnés en Tanzanie L’incidence de la tuberculose variait largement parmi les cohortes de patients infectés par le VIH

Tableau View largeTélécharger DiapositiveIncidence de la maladie de Mycobacterium tuberculosis chez les patients infectés par le VIHTable View largeTélécharger DiapositiveIncidence de la maladie de Mycobacterium tuberculosis chez les patients infectés par le VIHLe nombre de cellules CD médianes provenant d’études transversales chez des patients hospitalisés chez qui toutes les formes de tuberculose ont été diagnostiquées. μL dans les études en Côte d’Ivoire et étaient similaires dans le tableau des études de cohortes [,,,,] Les patients ambulatoires chez lesquels la tuberculose pulmonaire avait été diagnostiquée avaient un nombre médian de cellules CD / μL en République Démocratique du Congo et cellules / μL patients atteints de tuberculose extrapulmonaire à cellules / μL patients atteints de tuberculose pulmonaire en Côte d’Ivoire Les études autopsiques de patients infectés par le VIH dans des services médicaux en Côte d’Ivoire et au Kenya ont montré que la tuberculose Dans des études transversales portant sur des patients infectés par le VIH et gravement malades, la prévalence Le taux de bactériémie du complexe M avium était de% -% des patients hospitalisés en Zambie , au Kenya , au Malawi , en Tanzanie et en Ouganda , et atteignait Critères de suspicion de tuberculose en Afrique du Sud Le nombre moyen de cellules CD au moment du diagnostic du complexe de M avium disséminé était – cellules / μL dans les études kenyanes et sud-africaines Le taux de mortalité hospitalière associé au M avium bactériémie complexe était% patients au Kenya ,% patient en Afrique du Sud , et n’a pas été rapportée dans la plupart des études Les études d’autopsie en Côte d’Ivoire et au Kenya n’ont pas montré de complexe de M avium comme cause de décès

Infections bactériennes

S pneumoniae La prévalence de l’infection à S pneumoniae par les cultures de sang et d’expectoration variait de% des cas de pneumonie au Cameroun à% en Ouganda En utilisant l’examen des ponctions pulmonaires transthoraciques, thoracentèse et bronchoscopie chez des patients sélectionnés, la prévalence a été trouvé en% en Côte d’Ivoire et en% au Kenya Les taux d’incidence de pneumonie et de pneumococcie sont présentés dans le tableau [,,]

Tableau View largeTélécharger DiapositiveIncidence d’autres infections opportunistes chez des patients infectés par le VIHTable Voir grandDownload slideIncidence d’autres infections opportunistes chez des patients infectés par le VIHSur des patients infectés par le sang et infectés par le VIH et infectés par le VIH,% ont eu une infection pneumococcique en Tanzanie pendant la saison des pluies. ,% avaient une infection en Ouganda , et% avaient une infection au Malawi pendant la saison sèche La prévalence de la bactériémie à S pneumoniae chez les patients présentant des infections sanguines en Côte d’Ivoire variait de% dans un service de maladies infectieuses à une salle respiratoire ; il était de% -% parmi les patients bactériémiques infectés par le VIH admis au service de médecine générale dans un hôpital central au Kenya La pneumonie pyogénique était la principale cause de% de décès hospitalisés en Côte d’Ivoire et de% de patients hospitalisés au Kenya Le taux de létalité des pneumococcies invasives était de% parmi les patients communautaires dans une cohorte de recherche kenyane ,% au Cameroun ,% -% au Kenya et% de décès parmi les patients hospitalisés en Côte d’Ivoire d’Ivoire Salmonellaaspecies Les épisodes d’entérite bactérienne chez les patients infectés par le VIH représentaient% des admissions dans un service de maladies infectieuses en Côte d’Ivoire Chez les patients infectés par le VIH avec diarrhée aiguë, Salmonella Salmonella enteritidis et S enteritidis non infectées le sérotype Typhimurium était l’isolat de selles bactériennes le plus fréquemment récupéré à Bangui, en République centrafricaine et au Kenya L’entérite non salmonelleuse à Salmonella était une cause peu fréquente d’admissions à l’hôpital. Par cas-années d’observation dans les cohortes De fébriles, les patients infectés par le VIH avec une infection sanguine, une salmonémie non-salmonellose Salmonella a été détectée dans% -% en Tanzanie , au Malawi et en Ouganda hémoculture en% -% des patients hospitalisés au Kenya et Côte d’Ivoire Dans les études qui ont fourni des données de mortalité hospitalière,% des patients atteints d’entérite bactérienne sont décédés à Abidjan , alors que% des patients hospitalisés avec une bactériémie non salmonelleuse à Salmonella est mort au Kenya

Les infections fongiques

C néoformans Dans les études de cas soupçonnés de méningite chez les patients infectés par le VIH, la prévalence de la méningite cryptococcique était de% au Ghana en utilisant uniquement la coloration à l’encre pour le diagnostic ,% en Ethiopie et% -% en Afrique du Sud Méthodes de coloration, test d’agglutination au latex et culture Six pour cent des patients admis dans un service de médecine générale en République Démocratique du Congo ont été diagnostiqués Les taux d’incidence sont présentés dans le tableau [,,] avec les néoformans C et la co-infection VIH était des cellules / μL dans les études sud-africaines et ougandaises sur la méningite , et il s’agissait de cellules / μL chez des patients consécutifs dans une cohorte zimbabwéenne . Étude sur l’autopsie en Côte d’Ivoire et pourcentage de décès dans une cohorte infectée par le VIH en Ouganda Dans une cohorte d’Afrique du Sud avec un taux de mortalité inférieur, la méningite cryptococcique représentait% des décès PCP Parmi les patients infectés par le VIH avec respiration En Tanzanie, la prévalence de la PCP était de% -% dans les études tanzaniennes déterminées par examen des expectorations induites et des échantillons de lavage bronchoalvéolaire, dans certains cas ,% au Burundi , et% dans une étude du Zimbabwe dans cette étude. Tous les patients ont subi une bronchoscopie Utilisation d’un lavage broncho-alvéolaire et / ou d’une biopsie transbronchique chez des patients atteints d’une maladie pulmonaire n’ayant pas répondu à un traitement antibiotique standard et présentant des résultats normaux d’évaluations diagnostiques initiales de tuberculose, études au Rwanda , Malawi , Zambie , et la République Démocratique du Congo a trouvé une prévalence de% -% La prévalence était de% en Afrique du Sud et de% au Zimbabwe; Dans cette dernière étude, les patients devaient présenter des résultats radiographiques classiques de PCP L’incidence de PCP était faible dans le tableau des essais de cohorte, bien que des modalités diagnostiques variables aient été utilisées Le nombre médian de CD au moment du diagnostic était cellules / μL au Zimbabwe et n’a pas été rapporté dans d’autres études La PCP a été la principale cause de décès chez% -% des patients infectés par le VIH dans les séries d’autopsies du Kenya et de Côte d’Ivoire Candidaspecies La candidose œsophagienne variait de% chez les femmes enceintes séropositives à% des patients sénégalais hospitalisés atteints du SIDA [,,,] Les taux d’incidence sont présentés dans le tableau [,,] L’infection à Candida n’était pas une cause de décès dans ces études ou autopsies

Infections parasitaires

Paludisme De multiples études transversales réalisées en Afrique subsaharienne n’ont montré aucune association entre le paludisme et l’infection par le VIH [, -] Deux études transversales subséquentes sur des femmes enceintes du Malawi ont montré que la prévalence de la parasitémie palustre lors de la première visite prénatale était plus élevée. chez les femmes infectées par le VIH% et%, respectivement, que chez les femmes VIH – séronégatives% et%, respectivement, une tendance plus prononcée avec multigravidité Le risque de parasitémie et de fièvre paludisme cliniquement diagnostiqué était également significativement plus élevé chez les Dans cette cohorte, et dans le bras placebo d’un essai de vaccin ougandais, les taux de paludisme clinique étaient inversement proportionnels au nombre de cellules CD Tableau Toxoplasma gondii Quatre pour cent des patients infectés par le VIH en Ouganda. La Côte d’Ivoire a reçu un diagnostic confirmé de toxoplasmose cérébrale, évalué par tomodensitométrie et / ou une réponse thérapeutique au traitement L’incidence de la toxoplasmose était faible Le nombre de cellules CD médianes chez les patients hospitalisés en Côte d’Ivoire était de cellules / μL, et% de ces patients sont décédés lors de l’hospitalisation Une étude d’autopsie menée en Côte d’Ivoire a montré que la toxoplasmose était une [%] Cryptosporidium parvum, Microsporidiumspecies, et I belli La prévalence de l’infection à Cryptosporidium chez les patients souffrant de diarrhée chronique variait de bas en bas de% – % dans des études de la République centrafricaine , de la Tanzanie et du Zimbabwe au% au Kenya ,% -% dans des études zambiennes examinant plusieurs spécimens, y compris des échantillons de biopsie de l’intestin grêle et% -% dans les études rurales tanzaniennes et chez les patients ougandais et éthiopiens atteints de SIDA La cryptosporidiose était la principale cause de% des décès d’hospitalisation en Côte d’Ivoire et n’a pas été identifiée comme cause de décès au Kenya avec diarrhée chronique ea, l’infection à Microsporidium le plus souvent due à Enterocytozoon bieneusi avait une prévalence de% -% déterminée par coloration au trichrome ou par fluorescence des échantillons de selles en Tanzanie , au Kenya et en République centrafricaine , et la prévalence par la technique de sédimentation eau-éther au Zimbabwe Au Zimbabwe, la prévalence a été trouvée comme étant% par coloration au trichrome, et elle s’est avérée être% par PCR ; dans une étude zambienne dans laquelle des échantillons d’intestin grêle ont été obtenus par biopsie, la prévalence était de [%] La prévalence de l’infection à I belli variait de% patients urbains à% ruraux en Tanzanie La prévalence était% en République centrafricaine [ ], et la prévalence était de% -% dans une étude en Zambie dans laquelle des spécimens de biopsie intestinale ont été examinés Tableau fournit des données d’incidence pour la Côte d’Ivoire Le nombre médian de CD chez les patients hospitalisés était de cellules / μL en Côte d ‘Ivoire, et% de ces patients hospitalisés sont décédés alors qu’ils étaient hospitalisés

Infections virales

Virus varicelle-zona Chez les personnes infectées par le VIH, le zona a été cliniquement diagnostiqué en% des patients ambulatoires au Botswana et% des patients hospitalisés au Zimbabwe . L’incidence dans les cohortes d’Ouganda et du Rwanda est présentée dans le tableau Nombre de cellules CD et âge, le zona n’était pas un prédicteur de la mortalité précoce en Ouganda Cytomegalovirus Plusieurs études transversales ont effectué des examens oculaires chez des individus infectés par le VIH pour identifier la rétinite à cytomégalovirus Aucun cas n’a été trouvé parmi les patients infectés par le VIH en Gambie , des cas de rétinite à cytomégalovirus ont été diagnostiqués chez des patients burundais , et des cas de sida ont été diagnostiqués chez des patients malawiens La pneumopathie à cytomégalovirus était la principale cause de décès en% des patients kényens . décès parmi les patients hospitalisés en Côte d’Ivoire

Discussion

et le taux élevé de létalité associé reflète, en partie, l’absence de traitement abordable [-,] Bien que le PCP n’ait pas eu un impact similaire sur la mortalité tel qu’évalué par les données d’autopsie, il a probablement été sous-diagnostiqué. en Afrique subsaharienne [, -] et peuvent souvent être partiellement traités, étant donné la fréquence d’utilisation de TMP-SMZ et d’autres antibiotiques dans la région. Les parasites, tels que les espèces Cryptosporidium, Microsporidium et Isospora, ont provoqué la majorité des cas chroniques. diarrhée dans les études transversales, et les infections à ces parasites ont une incidence accrue chez les patients infectés par le VIH. Le complexe avium a été rarement rencontré chez les patients les plus malades et associé à des taux de mortalité élevés, bien que les études aient été peu nombreuses et limitées. La toxoplasmose a également été rarement notée, mais elle a été la cause de près de% des décès parmi les patients infectés par le VIH en Côte d’Ivoire , ce qui indique sa létalité et son sous-diagnostic probable. Des études limitées ont évalué les patients pour une infection par le cytomégalovirus et ont trouvé très peu de cas, l’infection à Candida et le zona ont été fréquemment diagnostiqués, probablement en raison de la prévalence élevée de l’infection et de la relative facilité du diagnostic. Bien que les chercheurs aient fait beaucoup de progrès dans la compréhension du VIH en Afrique subsaharienne, les données sur la prévalence et l’incidence dans la littérature sont limitées par plusieurs lacunes majeures: d’abord, peu d’études en Afrique subsaharienne observent les patients du moment de la séroconversion et qui enregistrent des données sur le nombre de cellules CD et les infections opportunistes sur de longues périodes. Encore moins d’études effectuent un suivi actif; la plupart dépendent d’un suivi passif pour diagnostiquer les infections La perte de suivi était souvent importante Deuxièmement, de nombreuses infections opportunistes peuvent être substantiellement sous-diagnostiquées en raison des limites cliniques et de laboratoire Troisièmement, plusieurs des études existantes ont des méthodologies très variées et comprennent de petites populations Bien que nous ayons tenté de mettre en évidence les caractéristiques des études pouvant expliquer les résultats variables, les comparaisons entre les études et les pays doivent être faites avec prudence. La prophylaxie efficace pour réduire l’incidence des infections opportunistes est la stratégie médicale actuelle dans de nombreux domaines. où le traitement HAART n’est pas encore largement disponible Compte tenu du fardeau de la tuberculose chez les Africains infectés par le VIH, l’utilisation du traitement préventif contre la tuberculose a fait l’objet de multiples études Une récente méta-analyse des essais prophylactiques antituberculeux – Les patients infectés ont montré une réduction de la tuberculose de plus d’un Les essais de TMP-SMZ impliquant des patients infectés par le VIH ont révélé des réductions variables de l’incidence d’événements graves, tels que la pneumonie bactérienne, l’entérite à Isospora, Infection à Salmonella non féphoïdale et parasitémie fébrile Le contrôle de ces infections à fort impact par un schéma simple et relativement bien toléré est intéressant. Cependant, cette intervention peut être limitée par la menace de résistance. sont faibles en Côte d’Ivoire mais sont ⩾% parmi les espèces de Salmonella au Kenya , Dakar et Malawi Les taux de résistance à S pneumoniae sont également variables L’effet clinique de ces profils de résistance reste incertain , et il existe d’autres préoccupations concernant la résistance croisée avec d’autres médicaments Bien que largement utilisé aux États-Unis, un premier essai de vaccin antipneumococcique en Afrique subsaharienne a montré une augmentation du taux de la morbidité associée au vaccin Plusieurs études préliminaires montrent que la multithérapie peut améliorer la fonction immunitaire et réduire les niveaux d’ARN du VIH en Afrique subsaharienne L’incidence des infections opportunistes dans cette région diminuera probablement, de même que Cependant, au fur et à mesure que des efforts sont déployés pour mettre en œuvre ces thérapies, la prophylaxie des infections opportunistes est une étape concomitante importante dans la prévention de la morbidité et de la mortalité associées. Infections opportunistes associées en Afrique subsaharienne Comment l’utilisation généralisée des schémas prophylactiques modifiera-t-elle la distribution des infections opportunistes et quels risques concurrents émergeront Quels seront les effets de l’utilisation accrue des antibiotiques sur les profils de résistance Comment les efforts initiaux impliquant HAART peuvent-ils être rapidement étendus? diminuer l’incidence des infections opportunistes ns et mortalité Enfin, quelle combinaison de vaccination, prophylaxie opportuniste d’infection, et HAART sera optimale? La combinaison de données d’observation avec des études d’intervention en cours permettra de répondre à ces questions

Remerciements

Nous remercions Jonathon Kaplan, MD, pour son aide avec ce projet et son manuscrit